捷克查理大学提供广泛的本科、硕士和博士课程，专业覆盖多个领域。以下是一些主要的专业分类：

人文和社会科学

历史

哲学

文学

语言学

社会学

政治学

心理学等

自然科学

物理学

化学

地理学

地质学

生物学

环境科学等

医学

医学

口腔医学

公共卫生

药学等

法律

法律

法律历史和比较法等

商学

会计学

管理

营销

经济

人力资源管理

MBA

国际管理等

教育

幼儿教育

中小学教育

英语教学等

科学及农学院

农业

应用科学

电脑

环境科学

生态

公园管理

休闲管理

古迹研究等

保健学院

护理

制药

医学

应用生物工程

职能治疗等

理工学院

计算机与软件

材料工程

电子计算机工程

工程物理

机械工程

医疗专业

保健专业

产科学

物理治疗

艺术史

古典文学

生命科学

材料科学

数学

物理学等

特定专业

分子生物学

生物医学工程

土木工程

电子计算机工程

材料工程

机械工程

数学

化学

人类学

考古学

语言文学文化

音乐

新闻

国际关系

艺术

经济学

金融

药学

解剖

临床医学等

此外，查理大学还提供体育运动系、药学院、德语授课、法语授课、西班牙语和俄语授课的专业等。

建议申请者根据个人兴趣和职业规划选择合适的专业，并提前了解各专业的课程设置和入学要求。