截至2025年，南通大学设有 26个学院和 1个独立学院（杏林学院）。这些学院包括：

1. 文学院（楚辞研究中心）

2. 理学院

3. 政治学院

4. 管理学院（商学院）

5. 商学院

6. 杏林学院

7. 教育科学学院

8. 外国语学院

9. 化学化工学院

10. 生命科学学院

11. 机械工程学院

12. 电子信息学院

13. 电气工程学院

14. 计算机科学与技术学院

15. 建筑工程学院

16. 纺织服装学院

17. 医学院（护理学院）

18. 公共卫生学院

19. 体育科学学院

20. 微电子学院（集成电路学院）

21. 交通与土木工程学院（交通学院）

22. 马克思主义学院（南通廉政研究中心、江苏省中国特色社会主义理论体系研究中心南通大学基地挂靠）

23. 艺术学院（建筑学院）

24. 地理科学学院

25. 药学院

26. 国际教育学院

建议访问南通大学官网获取最新和最准确的信息，因为学院设置可能会有变动。