深圳高三的课程设置如下：

必选科目

语文

数学

英语

选择性考试科目

物理

历史

思想政治

地理

化学

生物

根据“3+1+2”的考试模式：

“1”是指考生首选科目在物理和历史两门中选择1门。

“2”是指考生再选科目在思想政治、地理、化学、生物4门中选择2门。

因此，深圳高三共 六门课程。