复旦大学拥有多个系列院系，包括但不限于以下几类：

人文与社会科学类

复旦学院

中国语言文学系

历史学系

文物和博物馆系

旅游系

哲学学院

国际关系与公共事务学院

法学院

新闻学院

社会发展与公共政策学院

国际政治系

公共行政系

政治学系

经济学院

管理学院

社会科学基础部

自然科学类

数学科学学院

物理学系

核科学与技术系

化学系

高分子科学系

环境科学与工程系

生态与进化生物学系

遗传学和遗传工程系

微生物学与微生物工程系

生物化学系

生理学与生物物理学

电子工程系

通信科学与工程系

光科学与工程系

光源与照明工程系

材料科学系

力学与工程科学系

生命科学学院

医学类

上海医学院

公共卫生学院

药学院

护理学院

计算机科学与技术类

计算机科学技术学院

软件学院

微电子学院

大数据学院

航空航天系

其他

外国语言文学学院

广告学系

广播电视系

传播学系

英语语言文学系

德语语言文学系

俄语语言文学系

翻译系

法语语言文学系

日语语言文学系

朝鲜语（韩语）系

大学英语教学部

艺术设计系

复旦大学设有35个直属院系，涵盖了人文、法学、新闻、经济、管理、生命科学、医学、技术科学与工程、信息科学与工程等多个领域。这些院系为复旦大学提供了丰富的学术资源和科研平台，培养了大量优秀人才。