山东制药工程专业的排名如下：

山东大学：

全国排名第45位，星级排名4，专业档次为B++，属于中国高水平专业。

山东中医药大学：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

沈阳药科大学：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

广东药科大学：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

武汉生物工程学院：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

武汉工程大学：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

安徽中医药大学：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

西北大学现代学院：

全国排名较为靠前，具体名次未详细列出，但在山东省内排名较高。

齐鲁理工学院：

2025年排名山东省内第1。

山东农业大学：

2025年排名山东省内第2。

临沂大学：

2025年排名山东省内第3。

齐鲁师范学院：

2025年排名山东省内第4。

菏泽学院：

2025年排名山东省内第5。

枣庄学院：

2025年排名山东省内第6。

济宁医学院：

2025年排名山东省内第7。

烟台大学：

2025年排名山东省内第8。

潍坊学院：

2025年排名山东省内第9。

建议：

山东大学和山东中医药大学在全国制药工程专业排名中较为靠前，具有较高的声誉和学术实力，是报考的热门选择。

山东理工大学在山东省内排名较高，制药工程专业也具备一定的竞争力。

齐鲁理工学院、山东农业大学、临沂大学等学校在山东省内排名靠前，但具体排名可能有所变动，建议进一步核实最新数据。