上海交通大学拥有多个王牌专业，以下是一些被广泛认为是最优秀的专业：

船舶与海洋工程：

全国排名第一，专注于设计和开发高性能船舶、深海勘探设备等。

环境科学与工程：

全国排名第一，研究环境保护和可持续发展的科学问题。

生物工程：

全国排名第一，属于世界知名高水平。

生物医学工程：

全国排名第一，同样属于世界知名高水平。

信息工程：

全国排名第二，包含信息安全、软件工程、计算机科学与技术等专业。

机械工程：

全国排名第二，强调数字化设计和计算机辅助制造。

材料科学与工程：

涵盖材料科学、材料加工和材料表征等领域，全国排名第一。

计算机科学与技术：

毕业生在就业市场上具有高竞争力。

临床医学：

在国内医学院中学术排名高，培养具有高医学知识和技能的医生。

电气工程与自动化：

历史悠久，就业前景好，毕业生容易进入电力公司等高薪岗位。

土木工程：

土木工程系师资力量雄厚，注重学生的实践教育。

动力工程及工程热物理：

涵盖热力学、流体动力学、燃烧学等领域。

这些专业在各自的领域内具有很高的学术地位和影响力，毕业生通常有较好的就业前景和较高的社会认可度。请注意，专业的排名和声誉可能会随时间和各种评估标准的变化而变化。