扬州大学的一些冷门专业包括：

土木工程

建筑学

植物保护

化学类（包含专业：化学、应用化学）

兽医学

生物技术

化学工程

法学

档案学

农业机械化及其自动化

思想政治教育

宗教学

历史学

博物馆学

古生物学

尽管这些专业相对冷门，但某些专业如兽医学在就业方面表现出色，就业率百分之百。此外，一些冷门专业如哲学、历史学、思想政治教育等在考研方面具有一定优势，每年有不少学生考上一流高校的研究生。

建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各个专业的就业前景和发展潜力。