截至2024年，南京市共有 53所大学，其中包括35所本科学校和18所专科学校。部分知名大学有：南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学、南京农业大学、中国药科大学、南京师范大学、南京财经大学、南京邮电大学、南京审计大学、南京工业大学、南京信息工程大学、南京林业大学、南京中医药大学、南京医科大学、南京铁道职业技术学院、南京艺术学院、南京大学金陵学院、中国人民解放军陆军工程大学、东南大学成贤学院、南京航空航天大学金城学院等。