截至2024年，京都大学的专业涵盖了广泛的学科领域，包括文、理、工、医、法、经济等。具体专业如下：

综合人间学部

人类科学

国际文明学

文化环境学

认知情报学

自然科学

文学部

人文学科

哲学基础文化学

东洋文化学

西洋文化学

历史基础文化学

行动·环境文化学

基础现代文化学

教育学部

教育科学

现代教育基础学

教育心理学

相关教育系统论

法学部

基础法

公法

民刑事法

政治学

经济学部

经济学

经营学

理学部

理学

数学

物理学·宇宙物理学

地球惑星科学

化学

生物科学

医学部

医学（6年制）

人类健康科学

看护学

检查技术科学

理学疗法学

作业疗法学

药学部

药学科（6年制）

药科学

工学部

地球工学

建筑学

物理工学

情报学

电气电子工学

工业化学

农学部

资源生物科学

应用生命科学

地域环境工学

食物·环境经济学科

森林科学

食品生物科学

研究院

文学研究科

教育学研究科

法学研究科

经济学研究科

理学研究科

医学研究科

药学研究科

工学研究科

农学研究科

人类·环境学研究科

能量科学研究科

亚非地区研究科

信息学研究科

地球环境学大学院

公共政策大学院

经营管理大学院

综合生存学馆

这些专业为学生提供了丰富的学术和职业选择，涵盖了从基础研究到应用开发的广泛领域。