根据2025年QS世界大学排名，日本在哲学专业方面排名如下：

东京大学- 排名第32位

京都大学- 排名第50位

大阪大学- 排名第86位

建议：

东京大学和 京都大学在哲学领域的排名较高，均位于前50名，是日本哲学专业研究的强校，建议优先考虑。

大阪大学虽然排名稍低，但也在前200名之内，也是一个值得考虑的选项。