西南大学水产学院目前设置的专业有：

水产养殖学：

这是一个本科类专业，旨在培养具备现代水产动植物增养殖科学基本理论、基本知识和技能的高素质应用型和创业型研究人才。

水族科学与技术：

这也是一个本科类专业，专注于水族生物的养殖、研究以及相关技术的开发。

这两个专业均为国家级和重庆市级一流专业建设点，且水产学科是重庆市重点学科。