明治大学院的专业设置涵盖了多个学科领域，具体包括以下专业：

法学研究科

公法学专业

民事法学专业

商学研究科

商学专业

政治经济学研究科

政治学专业

经济学专业

经营学研究科

经营学专业

人文学部

英文专业

法文专业

艺术专业

理工学部

电气电子生命科学部

机械工学科

机械信息工学科

建筑学科

应用化学科

信息科学科

数学科

物理学科

农学部

农学科

农艺化学科

生命科学科

粮食环境政策学科

情报交流学部

情报交流学科

社会体系与公共性专业

组织与地区社会专业

多文化与国际协调专业

媒体与环境专业

国际日本学部

国际日本学科

综合数理学部

现象数理学科

一线媒体科学科

网络设计学科

其他研究科和专业职业研究生院

国际商务研究生院

会计高级研究生院

法学研究科（法学研究科）

这些专业和研究科为不同领域的学生提供了广泛的选择，从传统的法律、商学到新兴的理工、农学以及人文社科等，满足了多样化的学术和职业发展需求。