温州大学设有20个专业学院和荣誉学院—苏步青学院，提供54个在招本科专业。学科涵盖哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、医学、管理学、艺术学、交叉学科等门类。王牌专业包括小学教育、汉语言文学、化学、生物科学、机械工程、电气工程及其自动化、网络工程、工业工程、金融工程、国际经济与贸易等。此外，学校还有其他专业如思想政治教育、数学与应用数学、材料科学与工程、土木工程、服装与服饰设计、法学、教育技术学、学前教育、物理学、数据科学与大数据技术、服装设计与工程、体育教育、英语、电子信息科学与技术等。