高考理综中的难题主要集中在以下几个方面：

物理部分

物理题目往往涉及多个知识点，需要综合运用所学知识进行解答，这对学生的综合分析能力提出了较高要求。

物理题目在创新程度上较大，每年都会有新的题型出现，要求学生不仅要掌握基础知识，还要能够灵活运用这些知识解决新问题。

物理的最后一题或最后两道大题通常较难，需要较强的逻辑思维能力和空间想象能力。

化学部分

化学实验题（第22、26、27、31题）需要认真读题、仔细读数，规范连图，表述简洁准确，书写清楚工整。

化学的计算题涉及速率、平衡、反应等，理解原理和进行原理推算有一定难度。

生物部分

生物题目通常要求理解生物过程并应用相关知识，对理解力和记忆力要求较高。

高考理综中的生物实验题和分析与解答题也较为复杂，尤其是第25、31题，一本以上水平的学生能尽力完成或完成大部分，二本以下水平的同学难以全部完成。

综合来看，高考理综的难题主要集中在物理的最后一题、化学的实验题和计算题以及生物的理解和应用能力上。建议考生在备考过程中，重点加强这些方面的训练和准备。