根据教育部公布的第四轮学科评估结果，国内软件工程专业最好的大学如下：

北京航空航天大学：

获评A+，并列全国第一。

浙江大学：

获评A+，并列全国第一。

国防科技大学：

获评A+，并列全国第一。

北京大学：

软件工程学科实力强大。

清华大学：

软件工程学科实力强大。

华东师范大学：

软件工程学科实力强大。

南京大学：

软件工程学科实力强大。

武汉大学：

软件工程学科实力强大。

此外，哈尔滨工业大学、上海交通大学、中国科学技术大学、同济大学、北京理工大学等高校的软件工程专业也具有很高的声誉和实力。

建议：

北京航空航天大学和 浙江大学在软件工程领域的综合教学实力并列全国第一，是软件工程专业的首选。

北京大学和 清华大学作为顶尖学府，其软件工程学科同样具有极高的水平，适合追求顶尖学术和研究机会的学生。

哈尔滨工业大学虽然竞争相对较小，但其软件工程学科实力雄厚，且注重与国际接轨，适合希望在国际舞台上发展的学生。

南京大学和 武汉大学等综合性大学在软件工程领域也有很好的教学和科研实力，适合希望在不同领域发展的学生。