空军航天大学的专业设置涵盖了军事学和工学两大学科门类，具体包括以下专业：

飞行技术

侦察情报

目标工程

航空飞行与指挥

空中战勤

航空救生

电子对抗技术与指挥

无人机运用与指挥

装备仿真技术

情报分析整编

作战目标保障

部队组训管理

材料科学与工程

电子信息工程

自动化

计算机

交通运输

质量与可靠性工程

航天运输与控制

遥感科学与技术

这些专业构成了一个较为完备的学科专业体系，并与空军主体战斗力建设相配套，同时也注重基础教育、专业教育和飞行训练的融合。