1999年湖南高考的科目设置如下：

理科

语文：

120分

数学：

120分

英语：

100分

物理：

100分

化学：

100分

生物：70分

政治：

100分

文科

语文：

120分

数学：

120分

英语：

100分

历史：

100分

政治：

100分

地理：

100分

建议：

由于1999年是高考改革的重要年份，湖南与其他省份一样，采用了全国统一的考试科目设置，即理科和文科均包括语文、数学、英语，以及理科的物理、化学、生物和文科的历史、政治、地理。

这一时期的考试科目设置对后续的高考改革产生了一定的影响，为后续省份的高考科目设置提供了参考和借鉴。