扬州大学设有 32个学院（部）和 1个独立学院，开设 109个本科专业。这些专业涵盖了哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学、交叉学科等13大学科门类。扬州大学的王牌专业包括法学、思想政治教育、小学教育、体育教育、汉语言文学、英语、数学与应用数学、化学、生物技术、机械设计制造及其自动化、土木工程等。此外，扬州大学还拥有动物医学、农学、化学、数学与应用数学、水利水电工程、汉语言文学等特色专业。