南京高考理科考试的地点分布在南京市内的不同区域，具体考点如下：

玄武区

南京市第九中学（碑亭巷51号）

南京市第十三中学（西家大塘14号）

南京市人民中学（中山路178号）

秦淮区

南京市第一中学（中山南路301号）

南京市第五高级中学（莫愁路天妃巷121号）

南京市第二十七高级中学（平江府路166号）

南京师范大学附属中学秦淮科技高中（秦淮区红冠圩路科高南门）

鼓楼区

南京师范大学附属中学（察哈尔路37号）

南京市金陵中学

栖霞区 和 雨花台区

各设置一个高考考点，具体地址未详细列出

建议考生提前根据准考证信息或官方最新公告确认具体考点，以确保顺利参加考试。