国内交通运输工程专业的排名如下：

东南大学：

在教育部第四轮学科评估中获得A+评分。

西南交通大学：

在教育部第四轮学科评估中获得A+评分。

北京交通大学：

在教育部第四轮学科评估中获得A-评分。

北京航空航天大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为处于领先地位。

同济大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为具有较高科研水平。

中南大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为实力较强。

长安大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为处于领先地位。

大连海事大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为具有较高科研水平。

武汉理工大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为实力较强。

长沙理工大学：

在教育部第四轮学科评估中未明确评分，但被认为实力较强。

建议：

东南大学和 西南交通大学在交通运输工程专业方面处于领先地位，具有较为完善的学科体系和较高的科研水平，是考生的优选。

北京交通大学在学科评估中获得A-评分，拥有较强的科研实力和丰富的实践经验，也是考生的优选。

北京航空航天大学、 同济大学、 中南大学、 长安大学、 大连海事大学、 武汉理工大学和 长沙理工大学等高校在交通运输工程领域也有较强的实力，考生可以根据自身兴趣和职业规划选择合适的学校。