高三最好的学校是 清华大学和北京大学。这两所大学无论是综合实力还是世界排名都遥遥领先其他高校，是国内最顶尖的两所大学。此外，浙江大学、上海交通大学和复旦大学也是国内顶尖的综合性大学，各自在特定领域具有显著优势。

对于高三学生来说，选择大学时可以考虑这些学校的综合实力、专业优势、地理位置等因素。如果更关注学术实力和社会影响力，清华大学和北京大学无疑是最佳选择。如果希望在特定领域深造，浙江大学、上海交通大学和复旦大学也是很好的选择。