选择自考二建的专业时，可以考虑以下几个方面：

个人兴趣和职业规划

选择与自己兴趣和职业规划相符合的专业，可以提高学习的积极性和动力，从而更容易通过考试。

市场需求和就业前景

了解当前市场对各专业的需求情况，选择需求量大、就业前景好的专业，可以提高就业竞争力。

考试难度

不同专业的考试难度不同，选择相对容易通过的专业，可以提高通过率。

专业内容与应用

考虑专业内容的实用性和与自己专业背景的关联性，选择与之相关的专业，如机电、土木等。

未来晋升或转岗的需求

考虑未来晋升或转岗的需求，选择有助于职业发展的专业，如建筑工程专业适合想要成为项目经理或管理层级的考生。

综合以上几点，以下是一些建议：

建筑工程专业：这是最普遍的选择，考试内容相对基础，与日常生活联系紧密，适合初学者和零基础考生。此外，建筑工程专业也是历年通过率较高的专业。

机电工程专业：涵盖电气与机械知识，对于有一定理工科基础的考生来说，学习起来会相对轻松，市场需求稳定，就业前景较好。

市政公用工程专业：市场前景乐观，涉及市政工程建设一线的施工与管理等岗位，要求高等技术应用型人才，但考试难度较大。

公路工程专业：与地理、环境等自然因素密切相关，内容较为具体和专业，如果没有相关背景，可能需要更多时间来理解和掌握。

水利水电工程专业：虽然项目企业较少，但专业对口可以选择，前景乐观，适合作为增项考取。

根据以上分析，如果你对建筑行业感兴趣且希望未来从事相关管理工作，建筑工程专业是首选。如果你有一定的理工科背景，机电工程专业也是一个很好的选择。此外，市政公用工程、公路工程和水利水电工程也是市场需求较大、前景乐观的专业，但可能需要更多的专业知识和准备。

建议你根据自己的兴趣、职业规划及市场需求来选择最适合自己的专业。