烟台高三复读生的学籍通常由所复读的学校办理。具体操作流程如下：

原学校保管：

如果选择在原学校复读，学籍档案通常由原学校管理，不需要个人干预。

提取学籍：

如果选择在其他学校复读，则需要将学籍从原学校取出，然后交给新的复读学校。

复读学校办理：

复读学校会负责办理学籍的相关手续，包括在新学校报考和高考录取时的建档。

因此，无论是选择在原学校还是其他学校复读，学籍的处理都是由学校来负责的。建议选择有良好信誉和口碑的复读学校，以确保学籍的顺利转移和管理。