扬州大学有多个专业被认为是最好的，以下是一些被广泛认可的专业：

农学类专业：

扬州大学的农学类专业具有悠久的历史和深厚的学术积淀，为国家农业发展和农业科技创新培养了大量人才。农学类专业包括作物栽培学与耕作学、作物学等，其中作物栽培学与耕作学是国家级重点学科，作物学是江苏省高校优势学科。

医学类专业：

医学类专业在国内外享有较高的声誉，特别是在临床医学和基础医学领域。

工科类专业：

工科类专业近年来发展迅速，特别是在材料科学、电子信息工程等领域。

经济管理类专业：

这些专业在培养学生扎实的经济理论基础和实际应用能力方面具有显著特色。

兽医专业：

兽医专业据称全国排名第一，农学排名第八。

化学类专业：

化学专业在扬州大学也享有较高的声誉。

数学与应用数学专业：

数学专业被认为是王牌专业之一。

水利水电工程专业：

该专业在扬州大学也具有一定的优势。

汉语言文学专业：

汉语言文学专业被认为是王牌专业之一。

动物医学专业：

该专业在教育部全国第四轮学科评估中被评为A-，显示了其在兽医学领域的较高水平。

综合来看，扬州大学的农学类专业、医学类专业、工科类专业、经济管理类专业、兽医专业、化学类专业、数学与应用数学专业、水利水电工程专业和汉语言文学专业都是其王牌专业，具有很高的声誉和影响力。具体选择哪个专业，建议根据个人兴趣和职业规划来决定。