高三妹妹开学红包的金额并没有一个统一的标准，这主要取决于多个因素，包括家庭经济状况、学校传统、个人喜好以及寓意等。以下是一些常见的红包金额建议：

211元、985元：

这些数字代表考上211或985高校，是常见的寓意吉祥的数字。

168元、1666元：

这些数字也有吉祥的寓意，如一路顺风、一切顺利。

888元：

这个数字代表发财，也是常见的寓意吉祥的数字。

66元：

这是一个比较普遍且寓意吉祥的金额，适合大多数情况。

1200元：

在一些地方被视为比较吉利的金额，适合侄男侄女等亲戚。

2000元：

适合一些经济条件较好的家庭，可以表示对孩子的期望和祝福。

49份大红包：

金额从一千元到两万元不等，适合品学兼优的学生，尤其是考入名校的学生。

综合考虑，建议根据家庭经济状况和孩子的实际情况来决定红包金额。如果经济条件允许，可以选择一些有吉祥寓意的数字，如211、985、168、1666、888等。如果经济条件有限，可以选择一些普遍且寓意吉祥的金额，如66元或1200元。最重要的是，红包金额不在于多少，而在于心意和祝福。