在指挥类专业方面，以下几所院校被认为是最好的：

国防科技大学

特点：985工程院校，录取分数线高，部分专业分数接近清华北大。拥有多个军事学博士学位授权一级学科和军事硕士专业学位授权领域。合同战术学被列为国家级重点学科。

中国人民解放军海军军医大学（第二军医大学）

特点：211工程建设高校，隶属于后勤部主管。在军医领域具有很高的含金量，其指挥类专业同样备受认可。

中国人民解放军信息工程大学

特点：全国重点建设的5所院校之一，正军级编制。学科包括外国语言文学、计算机科学技术、测绘科学等，这些专业在指挥领域也有广泛应用。

空军工程大学

特点：位于陕西西安，正军级编制。拥有涵盖军事思想、军事历史、战略、战役、战术、作战指挥等领域的学科专业。

国防大学

特点：我国军队的最高学府，培养的是高级军官。其指挥系在全军具有极高的声誉。

陆军指挥学院

特点：位于江苏省南京市，是国防部公布的军改后的43所军校之一。前身为总高级步兵学校，1986年改称陆军指挥学院，正兵团级编制。学院在指挥类专业方面有着深厚的底蕴和丰富的教学经验。

海军指挥学院

特点：同样位于江苏省南京市，是海军的最高学府，主要培养海军的中高级指挥人才。学院占地面积48万平方米，拥有完善的教学设施和强大的师资力量。

空军指挥学院

特点：坐落于北京西郊著名风景区颐和园昆明湖畔，是一所培养空军师团职指挥军官的中级指挥院校。学院设有涵盖军事思想、军事历史、战略、战役、战术、作战指挥等领域的21个学科专业，拥有14个研究生学位授权学科。

建议

选择指挥类专业的学校时，建议综合考虑学校的整体实力、专业特色、录取分数线以及个人兴趣和发展方向。国防科技大学作为唯一一所985工程院校，在指挥类专业方面具有极高的声誉和地位，但录取分数线也相对较高。其他如海军军医大学、信息工程大学和空军工程等也有各自的优势和特点，可以根据个人情况选择最适合的学校。