平阴高三借读的学籍通常保留在原学校。具体操作如下：

借读期间保留原学籍：

学生在借读期间，其学籍仍保留在原就读学校。这意味着学生可以继续享受正规的教育资源和课程。

借读地的教育行政部门：

学生在借读地参加会考，成绩由借读地的市级教育行政部门出具并盖章。这些成绩连同原校的成绩和表现材料，需在学生借读期满时由本人带回原校。原校所在地的教育行政部门会接收并储存这些成绩信息。

重要文件的发放：

会考成绩单、合格证书以及毕业证书、修业证书、肄业证书等重要文件，均由原学校发放，确保了借读学生的权益和学业连续性。

借读手续的办理：

申请借读的学生需持证明材料向普通高中学校申请，学校审查同意后，到教育主管部门办理借读手续。在办理借读手续时，借读学校需同意接收证明并向学籍注册学校提出申请，待学校同意并办理正式手续后，学生方可外出借读。

综上所述，平阴高三借读的学籍保留在原学校，借读学生仍需在原学校参加会考并获取相关成绩和文件。借读手续的办理确保了学生的学业连续性和权益。