根据麦可思研究院发布的权威调查报告，从本科毕业生毕业半年后的就业率来看， 电气工程及其自动化专业在藏医学院中就业率最高。该专业的业务培养目标是培养能够从事与电气工程有关的系统运行、自动控制、电力电子技术、信息处理、试验分析、研制开发、经济管理以及电子与计算机技术应用等领域工作的宽口径"复合型"高级工程技术人才。业务培养要求学生主要学习电工技术、电子技术、信息控制、计算机技术等方面较宽广的工程技术基础和一定的专业知识。

此外，藏医学专业也是一个就业前景较好的专业。藏医学在中医学类7个专业中排名第4，在医学类44个专业中，就业排名第38。毕业生可以从事藏医医疗、教学、科研及藏药开发工作。藏医药学作为中华民族医药宝库中的一部分，历史悠久，内容丰富，随着人们对天然药物、传统疗法的肯定，藏医药学也在日益突破地域性的限制，对藏医药人才专业的需求也日益扩大。

综合考虑，电气工程及其自动化专业和藏医学专业都是藏医学院中就业前景较好的专业。电气工程及其自动化专业适合对工程技术有兴趣的学生，而藏医学专业则适合对传统医学和藏药开发感兴趣的学生。