新疆的三本大学主要包括以下几所：

新疆大学科学技术学院

新疆财经大学商务学院

新疆农业大学科学技术学院

新疆医科大学厚博学院

石河子大学科技学院

新疆师范大学喀什校区

这些院校在教学质量、师资力量、学科建设等方面具有一定的优势，提供全日制本科教育，并具有一定的特色和优势。在选择大学时，建议结合个人兴趣和职业规划进行综合考虑。