九州地区拥有多所知名大学，其中包括：

九州大学（Kyushu University），简称“九大”，是日本历史悠久的国立大学之一，也是九州地区的学术中心。九州大学的前身是1903年成立的福冈医科大学，1911年升格为日本七所旧制帝国大学之一。它以人文、社会、自然科学为主，尤其在医学、工程学、材料科学和环境科学等领域享有盛誉。九州大学有四个校区，其中伊都校区是主校区。

九州工业大学（Kyushu Institute of Technology），位于福冈县北九州市，是一所国立科技大学，专注于工程学和自然科学的教育和研究。

熊本大学（Kyoto University），位于熊本市，是一所国立研究型综合大学。

鹿儿岛大学（Kagoshima University），位于鹿儿岛市，是九州地区另一所重要的国立大学。

长崎大学（Nagasaki University），位于长崎市，也是一所国立大学。

大分大学（Oita University），位于大分市，同样是一所国立大学。

宫崎大学（Miyazaki University），位于宫崎市，是一所国立研究型综合大学。

久留米大学（Kurume University），位于福冈县久留米市，是一所公立大学。

北九州市立大学（Kitakyushu University），位于北九州市，是九州和四国地区外国语专业排名第一的大学。

九州产业大学（Kyushu Institute of Technology），虽然名称中包含“九州工业大学”，但它是一所不同的私立大学。

这些大学在各自的领域内都有显著的学术成就和特色，为九州地区乃至日本的教育和科研做出了重要贡献。