南沙区目前拥有以下大学：

中山大学

香港科技大学（广州）

暨南大学

广东外语外贸大学

广东药科大学

中山大学南沙科技学院

中山大学南沙珠江学院

广东金融学院

广州大学南沙校区

广州大学南沙科技学院

中国科学院大学广州校区

广州海洋大学研究生院

广州科技贸易职业学院

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