日内瓦有多所著名的大学，其中最为知名的是 日内瓦大学（Université de Genève，简称UniGe）。日内瓦大学是瑞士日内瓦州的一所公立大学，成立于1559年，前身是约翰·加尔文建立的日内瓦学院，1873年建立医学系后正式更名为大学。日内瓦大学享有国际声誉，是集合了欧洲12所最优秀的研究型大学的欧洲研究型大学联盟（LERU）的成员之一。学校位于日内瓦的中心地带，注重学生的思维方式、教师的教学水平以及师生间的对话和交流。日内瓦大学在多个领域都拥有卓越的研究实力，在国际上享有很高声誉，是欧洲研究型大学联盟以及科英布拉集团成员。

此外，日内瓦还有其他一些高等教育机构，但日内瓦大学是其中最为著名和知名的一所。