花都区有多间高校，包括：

广东第二师范学院 （原名广东教育学院）：公办2A类本科高校。

广东培正学院：

民办本科高校。

华南理工大学广州学院（原名汽车学院）：民办独立学院。

广东交通职业技术学院：

3A类，公办比较热门的大专。

广州大学市政技术学院：

3A类，公办比较热门的大专。

广东行政职业学院：

3A类，公办大专院校。

广州民航职业技术学院：

3A类，公办大专院校，花都校区为新校区。

广州铁路职业技术学院：

3A类，公办大专院校，花都校区为新校区。

广州大学纺织服装学院：

3A类，公办大专院校，位于赤坭镇蓝田。

广州工商职业技术学院：

3B类，民办大专院校，位于狮岭海布。

广东工业大学花都校区。

广东理工学院花都校区。

广东医科大学花都校区。

广东工贸职业技术学院。

广东建设职业技术学院。

广州城市理工学院：

由华南理工大学广州学院转设而来。

南方经贸学院。

广州市政建设学院。

广州商学院。

花都区广播电视大学。

广东海洋大学。

广东外语外贸大学：

虽然不是位于花都校区，但广东外语外贸大学附属花都学校位于花都区。

这些大学提供了多元化的教育资源，为花都地区培养了大量优秀人才。花都区以其发达的教育资源和优质的教育质量而闻名，吸引了许多学生前来就读。