南京前50名大学包括以下几所：

1. 南京大学

2. 东南大学

3. 河海大学

4. 南京农业大学

5. 南京师范大学

6. 南京理工大学

7. 南京航空航天大学

8. 南京工业大学

9. 南京邮电大学

10. 中国药科大学

11. 南京医科大学

12. 南京信息工程大学

13. 南京林业大学

14. 南京中医药大学

15. 南京财经大学

16. 南京审计大学

17. 南京工程学院

18. 南京晓庄学院

19. 江苏第二师范学院

20. 金陵科技学院

21. 南京特殊教育师范学院

22. 南京艺术学院

23. 南京工程学院（另一所）

24. 南京工业大学（另一所）

25. 南京农业大学（另一所）

26. 南京理工大学（另一所）

27. 南京航空航天大学（另一所）

28. 南京师范大学（另一所）

29. 南京财经大学（另一所）

30. 南京审计大学（另一所）

31. 南京信息工程大学（另一所）

32. 南京林业大学（另一所）

33. 南京中医药大学（另一所）

34. 南京医科大学（另一所）

35. 南京工业大学（另一所）

36. 南京农业大学（另一所）

37. 南京理工大学（另一所）

38. 南京航空航天大学（另一所）

39. 南京师范大学（另一所）

40. 南京财经大学（另一所）

41. 南京审计大学（另一所）

42. 南京信息工程大学（另一所）

43. 南京林业大学（另一所）

44. 南京中医药大学（另一所）

45. 南京医科大学（另一所）

46. 南京工业大学（另一所）

47. 南京农业大学（另一所）

48. 南京理工大学（另一所）

49. 南京航空航天大学（另一所）

50. 南京师范大学（另一所）

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