南沙区目前有以下本科大学：

广东外语外贸大学

中山大学南沙校区

广东药科大学

中山大学南沙科技学院

中山大学南沙珠江学院

广东金融学院

广州大学南沙校区

广州大学南沙科技学院

香港科技大学（广州）

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