同济大学在2025年排名较低的原因可以归纳为以下几点：

学科优势：

同济大学以工科见长，尤其在土木、桥梁、隧道、建筑等专业方面具有显著优势。然而，在经济学、医学、文科等其他门类学科方面表现一般，导致在综合排名中受到影响。

排名标准：

大学的排名通常是基于综合能力的比较，包括学术声誉、研究成果、师资力量、学生质量等多个维度。同济大学在某些非工科领域的表现可能不足以与其他顶尖综合性大学（如C9联盟学校）竞争。

学科评估结果：

根据第四轮学科评估，同济大学的A类学科数量相对较少，与浙江大学、上海交通大学等名校相比存在差距。

生源质量：

尽管同济大学位于上海，但其录取分数线可能不及华东五校，这可能影响了其生源质量，进而影响排名。

宣传与知名度：

近年来，同济大学的宣传力度可能不大，这可能影响了其在某些排名系统中的表现。

历史与发展：

在高校合并潮中，同济大学经历了合并后的磨合期，这可能在一定程度上影响了其排名。

地理位置：

虽然同济大学位于上海这一一线城市，这为其发展提供了便利，但同时也意味着它需要与众多优质高校竞争，这可能使得其在某些排名系统中相对处于不利地位。

市场导向：

同济大学逐渐转变为“应用型工科院校”，更加注重产学研结合和市场需求的满足。这种转变虽然使其在某些应用类专业上表现出色，但也可能导致其在传统学术研究和理论成果方面的表现不如一些以科研为主的综合性大学。

综上所述，同济大学在2025年排名较低的原因主要在于其学科优势主要集中在工科领域，而在其他学科方面的表现相对一般，同时在生源质量、宣传力度、历史与发展等多方面因素的综合影响下，导致其综合排名不如一些顶尖综合性大学。