合肥市瑶海区拥有多所高等教育机构，以下是部分位于该区的大专院校和本科院校：

安徽纺织工业学院（前身：安徽纺织技术培训班）

安徽体育运动职业技术学院

安徽广播影视职业学院

安徽职业技术学院

安徽能源技术学院

合肥铁路工程学院

安徽涉外学院

合肥市职工大学

安徽幼儿师范学院

安徽新闻出版职业技术学院

安徽林业职业技术学院

安徽艺术职业学院

徽商职业学院

安徽警官职业学院

安徽水利水电职业技术学院

安徽医学高等专科学校

安徽交通职业技术学院

安徽中医药大学（少荃湖新校区）

安徽农业大学经济技术学院

合肥工业大学

安徽大学艺术学院

瑶海区高教城专科院校

安徽合肥技师学院

安徽中澳科技职业学院

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