北京第二批理科院校包括以下几所：

1. 北京建筑大学

2. 北京中医药大学

3. 北方工业大学

4. 北京信息科技大学

5. 北京工商大学

6. 北京联合大学

7. 首都师范大学

8. 首都经济贸易大学

9. 北京电子科技学院

10. 外交学院

11. 中国劳动关系学院

这些大学在各自的理科领域有着较强的实力和特色，提供本科二批教育。如果您需要更详细的信息，如排名、录取分数线等，请告知。