二战时期，日本海军的教育体系包括以下几所著名的学校：

海军兵学校

成立于1888年，位于广岛县江田岛市，是旧日本帝国海军培养海军基础军官的主要学校。

海军机关学校

主要培养轮机、通讯等基础军官。

海军经理学校

主要培养医科、主计科等后勤军官。

海军炮术学校

前身为1893年开设的炮术练习所，后改编为海军炮术学校。

海军水雷学校

前身为1879年开设的水雷术练习所，后改编为海军水雷学校，位于神奈川县横须贺。

海军潜水学校

成立于1920年，位于广岛县大竹，1944年和1945年分别开设了柳井分校和七尾分校。

海军大学校

成立于1888年，位于东京，是海军高级军官的进修学校，废止于1945年。

海上自卫队干部学校

相当于日本海军大学校，是培养海上自卫队高级军官的学校。

防卫大学校

成立于1954年，位于神奈川县横须贺市，是培养自卫队干部（军官）的高等教育机构。

目前，日本没有以海军命名的大学，但是有两所著名的海事方面的国立大学，分别是：

东京海洋大学

Kobe University

这些学府在海事教育和研究领域具有很高的地位。