合肥的二本大学包括以下几所：

1. 安徽农业大学

2. 安徽医科大学

3. 安徽建筑大学

4. 安徽中医药大学

5. 合肥师范学院

6. 巢湖学院

7. 合肥学院

8. 安徽艺术学院

9. 安徽文达信息工程学院

10. 合肥城市学院

11. 合肥经济学院

12. 安徽医科大学临床医学院

13. 安徽三联学院

14. 安徽新华学院

15. 安徽大学江淮学院

16. 安徽建筑工业学院城市建设学院

请注意，以上信息以教育部门公布的最新权威信息为准，具体名单可能会有所变动。建议您在选择学校时，查看教育部门最新的官方公告以获取最准确的信息。