上海共有11所高校进入前100强，具体名单如下：

1. 复旦大学

2. 上海交通大学

3. 同济大学

4. 华东师范大学

5. 上海科技大学

6. 华东理工大学

7. 上海财经大学

8. 海军军医大学

9. 上海大学

10. 上海理工大学

11. 东华大学

这些高校中，有7所是双一流建设高校（复旦大学、上海交通大学、同济大学、华东师范大学、上海科技大学、华东理工大学、东华大学），并且全部都是211工程高校。这些高校在国内外享有较高的学术声誉和影响力，涵盖了文、理、工、医、师范等多个学科领域。