大学校史研究中存在的问题主要包括以下几个方面：

家史化：

校史过分强调学校内部的历史，忽略了学校与社会、历史大环境的联系。

正史化：

校史内容倾向于正式和官方，缺乏对非官方和多元视角的包容。

上层史：

研究重点往往放在学校的高层管理和决策上，忽视了普通师生和基层教育实践的历史价值。

空洞化：

校史内容可能过于泛化，缺乏深入分析和具体案例的支撑。

学科定位不明确：

校史研究的学科属性不清晰，影响了研究的系统性和专业性。

编撰机构职能不足：

校史编撰机构可能缺乏足够的专业知识和资源，导致校史质量不高。

缺乏历史学者参与：

校史撰写往往由非历史专业背景的人员完成，影响了研究的深度和准确性。

校史研究的“显学”地位不足：

由于上述问题，校史研究的地位和影响力未能得到充分提升。

史不如志：

校史侧重政治史等现象，忽视了学校发展过程中的其他重要方面。

编写建国后校史的必要性和重要性：

近年来，不少高校开展了编写高校校史的工作，尤其是编写建国后校史的工作，这是校史理论研究的新课题。

校史研究的学术性：

校史研究应注重其学术性，尊重基本史实，理顺发展脉络，传承大学精神，办学理念。

这些问题的存在影响了校史研究的质量和深度，也制约了校史研究在高等教育领域中的地位和影响力。因此，明确校史研究的学科定位、推动校史研究的专业化、加强校史文献资料建设、鼓励历史学者参与等措施，对于提升校史研究的质量和影响力具有重要意义。