高三学生申请休学需要遵循以下步骤：

准备申请材料

由学生或父母/监护人向学校提出书面申请。

提供县（区）级以上医院的病历、主治医生的诊断证明、出院小结、建休证明、电脑打印的原始票据等。

学校审核

学校审核确认无误后，由学籍管理员填写休学呈批表。

班主任、校医、教务（导）主任、校长亲笔署名签章后，报教育主管部门审批。

教育主管部门审批

教育主管部门从收到休学申请之日起，指定该生到定点医院复检。

经核实后十个工作日内给予学校能否休学的明确答复。

休学手续

学校接休学批复后，通知学生监护人，同意该生休学。

休学时间从伤病或不可抗拒的因素导致缺课起始日计算，休学期为一年，不得提前或推迟复学，也不得中途到其他学校上学。

网上操作及教育局审核

之后在网上进行休学操作，并提交教育局审核。

休学期满后续

休学期满，由学校提交教育局审核回复学生网络电子学籍。

因伤病和本人不可抗拒的原因休学期满仍不能复学的，报批后，续办休学手续。

休学批复存档

休学批复应留在学校作存档之用，作为学生的学籍档案保存五年，不得遗失。

建议提前准备好相关证明材料，如身体或心理健康检查证明等，并在提出申请后，学校或教育局将对申请进行审批，并在审批通过后办理相关手续，如签订协议、办理休学手续等。请注意，休学期间需要在规定时间内到学校报到并缴纳相关费用，不得从事违法活动或违反学校规定的行为。