南通大学拥有多个学院，以下是部分学院的列表：

1. 杏林学院（独立学院）

2. 文学院

3. 理学院

4. 马克思主义学院

5. 经济与管理学院（与江苏长江经济带研究院合署）

6. 教育科学学院

7. 教师教育学院（教师教育管理处合署）

8. 外国语学院

9. 化学化工学院

10. 生命科学学院（海洋学院）

11. 机械工程学院

12. 信息科学技术学院（阿里云大数据学院、计算机科学与技术学院）

13. 电气工程学院

14. 纺织服装学院

15. 医学院（护理学院）

16. 公共卫生学院

17. 体育科学学院

18. 艺术学院（建筑学院）

19. 地理科学学院

20. 交通与土木工程学院（交通学院）

21. 药学院

22. 国际教育学院

23. 继续教育学院

24. 张謇学院

25. 通科微电子学院

以上信息根据2022年4月学校官网的数据整理得出。