北流市目前至少拥有一所高等院校，即 广西开放大学。这所大学是由广西壮族自治区人民政府举办、建设和管理的，以提供终身教育及服务为宗旨，依托现代信息技术，面向全民提供教育，支持终身学习的理念。广西开放大学的前身为1979年创办的广西广播电视大学，在2020年12月更名为广西开放大学。

此外，北流市还有一所公立本科院校，即 北部湾大学。北部湾大学位于钦州市，是广西沿海地区唯一的公立本科院校。学校的前身为1973年创办的钦州地区师范学校，经过发展，于2006年升格为钦州学院，并于2015年搬迁至钦州市滨海新城。

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