怀远县拥有多所高等教育机构，其中包括：

安徽怀远师范学校：

简称怀远师范，前身为1952年创办的怀远初级师范学校，是安徽较早成立的师范学校之一，2015年被评为安徽省省级示范中职学校。

蚌埠学院：

提供多种学科的本科教育。

蚌埠工商学院：

提供各类本专科教育。

安徽电子信息职业技术学院：

专注于电子信息技术领域的职业教育。

蚌埠经济技术职业学院：

提供职业技能培训教育。

安徽财经大学：

提供经济学和管理学等领域的本科及研究生教育。

蚌埠医科大学：

专注于医学领域的教育与研究，前身东南医学院1949年迁至怀远。

怀远开放大学（原怀远电大）：

提供远程开放教育，主要面向成人。

安徽省怀远高等师范学校：

主要以培养中小学教师为主，1998年开始招收初中起点的五年制专科生和高中起点的三年制专科生，2005年起与淮北师范大学、合肥师范学院等多所名校联合办学，开始招收网络教育和函授本科生。

安徽科技学院龙湖校区：

提供科学技术类专业的教育。

这些学校提供了从本科到专科不同层次的职业教育和培训，涵盖了工、理、管、文、法、医等多个学科领域，为怀远县及周边地区的人才培养做出了重要贡献。