巴东县至少有一所高等院校，即 湖北巴东开放大学。此外，巴东县还有以下教育机构：

恩施开放大学巴东县分校，与巴东县民族职业高级中学合署办公，提供职业技术教育、学历提高教育、人力资源开发、实用技术培训、农村劳动力转移和社区教育等服务。

巴东一中，始建于1943年，是湖北省示范高中、全国文明单位，有着“荆楚名校”之称，并且与多所高校建立了优质生源基地关系。

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