花莲县内的主要大学包括：

国立东华大学

地址：花莲县寿丰乡志学村大学路二段一号

特色：台湾东部首座综合大学，以科学和工程专业见长

私立慈济大学

地址：花莲市中央路三段701号

特色：生物医学专业较为著名

私立慈济技术学院

特色：技术和职业培训机构，以信誉和优质学生著称

台湾观光学院

特色：专注于观光旅游领域的教育

大汉技术学院

地址：屏东县车城乡后湾路2号（海生馆内）

注意：大汉技术学院已于2024年5月宣布停招停办

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