边疆冷门大学主要包括以下几所：

黑龙江工业学院：

位于中俄边境城市鸡西，以工学为主，特色专业有测绘工程等。

喀什大学：

位于最西部，前身喀什师范学院，是中国中西部高校基础能力建设高校之一。

海南热带海洋学院：

位于海南省，由多方共建，特色专业有海洋科学等。

黑河学院：

位于中俄边境线上中国境内，是中俄合作应用型人才培养实验区。

伊犁师范大学：

位于新疆伊宁市，是一所省部共建高校，代表专业优势明显。

兰州大学：

尽管地理位置较偏远，但教育质量和科研实力一直名列前茅。

河海大学：

位于南京市，拥有优越的地理位置和丰富的教育资源，尽管是一所“211工程”高校，但相对其他沿海地区的211大学，其知名度较低。

云南大学：

中国西部边疆最早建立的综合性大学之一，尽管是一所“211工程”高校，但由于地理位置等原因，其知名度和吸引力相对较低。

长安大学：

国家“211工程”重点建设大学和国家“985工程优势学科创新平台”建设高校，尽管是一所冷门但实力雄厚的大学。

哈尔滨工程大学：

因哈军工的部分历史而知名度不高，但实际上它在工程领域有着很高的声誉和实力。

黑龙江中医药大学：

在中医药领域具有很高的声誉，但由于未能入选“双一流”，其知名度相对较低。

沈阳药科大学：

在药学领域具有很高的声誉，被誉为“南北双药”之一，但由于学科较为专一，其综合知名度相对较低。

这些大学虽然地理位置较为偏远，但各有其特色和优势。对于希望在这些地区深造的学生来说，这些学校可能提供独特的学术环境和专业选择。建议根据个人兴趣和职业规划，综合考虑学校的特色和专业优势，做出合适的选择。