高三理科生主要参加的考试是 全国卷理科综合卷，该卷包含以下科目和分数分配：

语文：

150分

数学：

150分

英语：

150分

理科综合（物理、化学、生物）：300分，其中物理科目通常占110分，化学科目占100分，生物科目占90分。

因此，高三理科建档考试主要考察的科目是语文、数学、英语和理科综合（物理、化学、生物）。不同省份可能会有不同的自主命题权，例如江苏、上海、山东等省市可能会有不同的试卷和分数分配。